281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3715 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 305 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.19 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  43.56 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.06 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  38.28 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.62 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  34.3 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.94 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  32.56 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.37 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.79 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.69 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.28 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  34.93 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.44 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.94 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.97 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  26.97 
 
 		 344 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  32.98 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.48 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.17 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.94 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.49 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.64 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.1 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  25.25 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.5 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.9 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.83 
 
 		 328 aa  85.9  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  26.42 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  24.69 
 
 		 323 aa  85.9  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  24.69 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.63 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  23.79 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.33 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.04 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.76 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44059  predicted protein  25.5 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273474  normal  0.171571 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.13 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  25.32 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  30.47 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  31.78 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  29.44 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.51 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  27.39 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  25.53 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.41 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.58 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.64 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  32.63 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.06 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.22 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.14 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>