294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2557 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
314 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  90.97 
 
 
313 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  62.09 
 
 
312 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  48.01 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  54.44 
 
 
312 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  44.01 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  39.2 
 
 
323 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  36.75 
 
 
321 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  34.11 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33.78 
 
 
333 aa  175  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 
327 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.11 
 
 
345 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.6 
 
 
323 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 
326 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 
330 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 
320 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  36.75 
 
 
323 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  36.69 
 
 
323 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  36.43 
 
 
323 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 
321 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  34.64 
 
 
321 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 
321 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 
316 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 
321 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  34.57 
 
 
326 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.33 
 
 
340 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  35.51 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  37.84 
 
 
329 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  38.04 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.3 
 
 
326 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  35.06 
 
 
330 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 
319 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  37.7 
 
 
338 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.27 
 
 
330 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.39 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.08 
 
 
319 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.13 
 
 
348 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 
329 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  35.94 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 
319 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  37.8 
 
 
327 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 
324 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  35.06 
 
 
333 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  41.49 
 
 
334 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.41 
 
 
316 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  41.49 
 
 
334 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  40.66 
 
 
334 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  41.49 
 
 
334 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  37.55 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 
317 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 
317 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  37.65 
 
 
350 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.39 
 
 
314 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  40.66 
 
 
334 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  40.66 
 
 
334 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 
326 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  36.63 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  34.2 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 
318 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 
348 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 
325 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 
382 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  25.94 
 
 
318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.34 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 
326 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 
325 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 
325 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.74 
 
 
316 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 
314 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.43 
 
 
319 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 
319 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 
325 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 
358 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
320 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.55 
 
 
310 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 
345 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
318 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 
327 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 
317 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 
324 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>