More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7398 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 338 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  39.48 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  36.5 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  36.2 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  36.5 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  36.5 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  34.86 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  39.69 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.86 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  34.66 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  35.17 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  35.28 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.25 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  38.69 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.17 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.75 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  36.22 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.03 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  38.24 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.37 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.55 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.03 
 
 		 324 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  31.62 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  36.02 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.99 
 
 		 340 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  38.24 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.84 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  36.11 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.01 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  35.46 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.96 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  34.24 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  33.1 
 
 		 297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.75 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.89 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 332 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.82 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  27.95 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  30.11 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  30.31 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.49 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  30.92 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>