296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3534 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
328 aa  649    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  69.91 
 
 
333 aa  458  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 
325 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.02 
 
 
324 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 
325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
325 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 
325 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 
325 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 
325 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 
325 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.37 
 
 
327 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.88 
 
 
323 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.88 
 
 
323 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  37.13 
 
 
342 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.64 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.06 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.12 
 
 
326 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 
316 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.91 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
318 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
326 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 
305 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  27.19 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.13 
 
 
310 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.89 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.43 
 
 
319 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 
320 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.37 
 
 
346 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 
329 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 
314 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 
336 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 
311 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 
319 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 
328 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.23 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  28.29 
 
 
346 aa  99  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.17 
 
 
336 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  26.41 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  26.41 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.65 
 
 
313 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 
320 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.49 
 
 
312 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.03 
 
 
334 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.85 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.93 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
345 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  28.57 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  25.75 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.86 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 
330 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.02 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 
323 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  33.81 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 
329 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  25.43 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.73 
 
 
351 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  29.78 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.85 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.71 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 
325 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>