277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0682 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 357 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  60.86 
 
 		 369 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  64.22 
 
 		 382 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  58.88 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  58.88 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  56.9 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  57.51 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  58.58 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  56.8 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  57.01 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  57.35 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  56.12 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  56.18 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  55.22 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  57.77 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  59.52 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  55.82 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  55.88 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  58.46 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  56.65 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  58.16 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  59.88 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  57.86 
 
 		 359 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  55.72 
 
 		 350 aa  358  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  55.92 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  56.07 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  52.96 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  53.1 
 
 		 348 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  55.29 
 
 		 352 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  56.93 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  52.37 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  55.89 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  53.85 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  61.14 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  55.09 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  62.11 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  49.41 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  52.03 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  55.43 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  56.63 
 
 		 334 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  46.88 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  44.22 
 
 		 345 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.8 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.8 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.66 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.01 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.43 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  34.9 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.62 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.61 
 
 		 319 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  32.45 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  34.55 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  38.82 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.98 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  36.48 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  33.93 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  32.94 
 
 		 321 aa  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.18 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.04 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.58 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.06 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  35.77 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.13 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.36 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.28 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.98 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  35.84 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.74 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.28 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>