275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4693 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 349 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  69.05 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  68.18 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  67.9 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  67.43 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  66.27 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  65.37 
 
 		 354 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  64.9 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  68.36 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  68.06 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  68.06 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  67.46 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  70.66 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  67.46 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  63.82 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  64.37 
 
 		 349 aa  424  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  72.34 
 
 		 328 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  64.69 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  60.53 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  63.47 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  60.53 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  61.68 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  61.08 
 
 		 352 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  56.93 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  56.33 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  56.02 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  61.68 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  57.35 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  59.52 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  58.38 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  53.82 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  57.53 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  54.82 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  55.72 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  53.01 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  55.19 
 
 		 346 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  57.49 
 
 		 343 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  51.2 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  58.39 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  54.22 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  53.06 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  50.86 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  45.07 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  45.07 
 
 		 336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  44.98 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  34.93 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.84 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.15 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.96 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.08 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.93 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.31 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.98 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.53 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.37 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.93 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  34.78 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.73 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.11 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.73 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.44 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>