270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1216 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  90.17 
 
 		 348 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 350 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  74.93 
 
 		 358 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  74.93 
 
 		 358 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  74.64 
 
 		 358 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  75.73 
 
 		 351 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  73.99 
 
 		 350 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  70.97 
 
 		 346 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  68.8 
 
 		 357 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  67.85 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  64.14 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  60.53 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  60.35 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  59.16 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  56.98 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  58.91 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  57.23 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  57.06 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  61.23 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  60.95 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  57.83 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  59.05 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  57.53 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  57.1 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  56.55 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  60.61 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  62.34 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  51.94 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  55.36 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  65.3 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  57.53 
 
 		 349 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  56.71 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  65.71 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  56.32 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  55.82 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  55.29 
 
 		 362 aa  350  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  56.16 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  56.16 
 
 		 359 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  55.86 
 
 		 359 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  55.26 
 
 		 359 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  55.26 
 
 		 359 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  48.35 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  41.27 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  41.27 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  40.77 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.46 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.21 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.74 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.36 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 317 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 325 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 325 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.63 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.07 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 329 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.56 
 
 		 351 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 320 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.55 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.7 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 329 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 315 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.41 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  28.86 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.63 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 		 311 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.96 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  28.84 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>