More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1639 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
338 aa  671    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  67.46 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  63.77 
 
 
331 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  58.68 
 
 
329 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  59.65 
 
 
351 aa  394  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  58.26 
 
 
359 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  49.7 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  47.08 
 
 
326 aa  285  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  43.62 
 
 
326 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  44.81 
 
 
320 aa  261  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  42.09 
 
 
319 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  41.19 
 
 
319 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  43.32 
 
 
324 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  43.23 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  45.67 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  44.84 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  34.02 
 
 
329 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 
316 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.56 
 
 
302 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.34 
 
 
323 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.34 
 
 
323 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 
331 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 
326 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.64 
 
 
340 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 
325 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.31 
 
 
325 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 
327 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 
325 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 
326 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  37.17 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 
323 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
337 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  38.49 
 
 
314 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 
354 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  33.64 
 
 
330 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
345 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 
336 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 
336 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  38.3 
 
 
332 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  32.64 
 
 
323 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  34.55 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 
338 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 
326 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 
315 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  28.45 
 
 
328 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.96 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.39 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34.01 
 
 
319 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 
316 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  25.15 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.93 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.12 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  32.59 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.94 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 
345 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.6 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 
333 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  34.55 
 
 
313 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 
327 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 
323 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  35.96 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  31.78 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.38 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  35.34 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.54 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
348 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.41 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  30.97 
 
 
319 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 
321 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.96 
 
 
325 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>