More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2752 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  40.89 
 
 
326 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  40.66 
 
 
316 aa  208  8e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  37.7 
 
 
326 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  39.94 
 
 
325 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  39.88 
 
 
325 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  38.34 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  38.34 
 
 
325 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  38.34 
 
 
325 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  41.03 
 
 
324 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  38.44 
 
 
325 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 
325 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  34.08 
 
 
323 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  34.08 
 
 
323 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  38.66 
 
 
325 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 
325 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  41.37 
 
 
329 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  39.48 
 
 
338 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  40.25 
 
 
328 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  40.97 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  38.51 
 
 
319 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 
324 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  37.42 
 
 
314 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  36.45 
 
 
327 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  36.77 
 
 
319 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  37 
 
 
329 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  37.46 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 
328 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
329 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  39.07 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  39.69 
 
 
316 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  35 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  36.56 
 
 
338 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 
329 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.24 
 
 
310 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.26 
 
 
326 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 
315 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  37.96 
 
 
323 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40 
 
 
313 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  35.96 
 
 
320 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  39.51 
 
 
315 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  43.4 
 
 
332 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  41.38 
 
 
342 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  33.24 
 
 
359 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  35.92 
 
 
330 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 
330 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  36.1 
 
 
329 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.62 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 
316 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  38.69 
 
 
328 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.78 
 
 
332 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  36.9 
 
 
311 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 
319 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  34.28 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  36.27 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  40.23 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 
318 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 
318 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.44 
 
 
351 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.56 
 
 
303 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  36.01 
 
 
298 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.6 
 
 
348 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  37 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  39.77 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  36.5 
 
 
315 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  34.91 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.59 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  36.59 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 
332 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 
318 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  38.58 
 
 
311 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.63 
 
 
298 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  38.13 
 
 
345 aa  136  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33 
 
 
309 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  35.12 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.81 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 
345 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.21 
 
 
296 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.15 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  35.38 
 
 
351 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.13 
 
 
325 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.89 
 
 
323 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.45 
 
 
304 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  37.3 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  34.5 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  37.3 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  33.78 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>