272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0322 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
317 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0752  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  60.28 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.998821  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.3 
 
 
324 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.62 
 
 
351 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 
329 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.36 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.83 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.61 
 
 
325 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.31 
 
 
325 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.68 
 
 
319 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.93 
 
 
326 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 
330 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  29.23 
 
 
317 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 
325 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 
325 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 
359 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 
325 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.58 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.1 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
329 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  32.82 
 
 
325 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.07 
 
 
316 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.84 
 
 
326 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 
302 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.37 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.25 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 
314 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  32.72 
 
 
327 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
319 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 
342 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  37.89 
 
 
353 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
326 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 
324 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 
321 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 
357 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 
318 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
318 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 
322 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  31.9 
 
 
330 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 
313 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  27.07 
 
 
338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.19 
 
 
328 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 
323 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.29 
 
 
332 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 
321 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 
348 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 
314 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 
319 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 
330 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  33.54 
 
 
333 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  33.02 
 
 
319 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 
333 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 
316 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  31.31 
 
 
349 aa  99.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 
328 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 
350 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  31.15 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
344 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 
345 aa  98.2  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
350 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  30.91 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  33.85 
 
 
359 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 
315 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  29.23 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  29.2 
 
 
358 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
359 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  28.94 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.31 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  22.81 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
320 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29.01 
 
 
354 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>