267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4886 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 345 aa  711    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  69.88 
 
 		 333 aa  487  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  71.08 
 
 		 333 aa  476  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  71.17 
 
 		 330 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  65.71 
 
 		 321 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  63.46 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  64.54 
 
 		 321 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  64.54 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  61.59 
 
 		 321 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  59.29 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  48.49 
 
 		 323 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  40.69 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  38.32 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  37.5 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.63 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  35.33 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.79 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  37.07 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.69 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  39.63 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.18 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.55 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  36.14 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 		 329 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.56 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  30.03 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.78 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  31.01 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  31.8 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  30.03 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.82 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  30.99 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.01 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.59 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.78 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  31.73 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  31.38 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.94 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.73 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  30.67 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.4 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  33.92 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  29.44 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.13 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.37 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  31.29 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.13 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>