265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0151 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
327 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  69.06 
 
 
323 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  67.08 
 
 
326 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  69.38 
 
 
323 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  69.38 
 
 
323 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  69.06 
 
 
323 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  69.06 
 
 
323 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  68.44 
 
 
323 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  36.67 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  35.19 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  35.2 
 
 
330 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  35.33 
 
 
345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 
314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
321 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
333 aa  159  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 
333 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.1 
 
 
312 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 
321 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 
320 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
321 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
321 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 
319 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.88 
 
 
340 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 
313 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 
328 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  35.09 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 
302 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  36.39 
 
 
312 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.63 
 
 
319 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.12 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.93 
 
 
311 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  31.04 
 
 
331 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.53 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 
316 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 
331 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 
338 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 
329 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.11 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 
326 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 
365 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  32.12 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 
325 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 
319 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.89 
 
 
351 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 
325 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
350 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 
325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 
351 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 
325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
350 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.31 
 
 
325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 
350 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  34.58 
 
 
330 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 
325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 
329 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 
314 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 
315 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 
342 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 
316 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 
328 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 
316 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  34.41 
 
 
343 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 
359 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 
359 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 
315 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
359 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  28.04 
 
 
338 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  32.93 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
343 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 
317 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 
317 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.85 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
365 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.18 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  28.97 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  30.03 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.06 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
328 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>