262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000639 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 319 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  57.81 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  49.03 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  46.65 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  50.49 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  49.19 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  47.71 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  48.68 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  47.25 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  47.9 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  45.81 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  46.03 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  44.76 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  44.76 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  46.45 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  45.08 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  45.31 
 
 		 334 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  45.08 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  43.18 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  36.69 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  35.94 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  37.55 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.9 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.43 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  34.58 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.73 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.05 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  31.49 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 		 313 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  27.24 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  35.39 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.82 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  25.88 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.54 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.84 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.86 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.94 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 		 324 aa  99  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  26.81 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.86 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.85 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.92 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  26.13 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  26.01 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  25.99 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>