295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2032 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
332 aa  653    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  74.62 
 
 
342 aa  484  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  73.11 
 
 
332 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  63.83 
 
 
336 aa  385  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  38.56 
 
 
316 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  36.23 
 
 
325 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.02 
 
 
326 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.72 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 
326 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
325 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
325 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  43.78 
 
 
302 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.72 
 
 
325 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.92 
 
 
324 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
318 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.72 
 
 
325 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 
325 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  37 
 
 
316 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.44 
 
 
323 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32 
 
 
326 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.44 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 
328 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
329 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 
329 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 
331 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 
327 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.79 
 
 
319 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
329 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  34.51 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.06 
 
 
319 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  39.13 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  38.4 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  32.01 
 
 
330 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 
317 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.71 
 
 
319 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.35 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  40 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.84 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  36.67 
 
 
333 aa  129  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  37.79 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  42.04 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  34.92 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  37.83 
 
 
327 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  35.46 
 
 
327 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.49 
 
 
338 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  36.51 
 
 
330 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 
335 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 
329 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.04 
 
 
328 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 
318 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  32.29 
 
 
320 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  36.09 
 
 
350 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.83 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  36.73 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.37 
 
 
325 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  41.71 
 
 
334 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.45 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.05 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 
328 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 
311 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 
321 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 
319 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.66 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  39.3 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.37 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  37.12 
 
 
313 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 
318 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  31.36 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.58 
 
 
306 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  37.3 
 
 
333 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.06 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
348 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 
323 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.55 
 
 
325 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  38.59 
 
 
333 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>