269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6019 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  98.5 
 
 		 334 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  100 
 
 		 334 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  95.81 
 
 		 334 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  95.81 
 
 		 334 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  90.12 
 
 		 334 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  96.41 
 
 		 334 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  73.31 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  73.17 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  73.17 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  64.83 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  58.95 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  57.27 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  60.06 
 
 		 325 aa  338  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  55.79 
 
 		 338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  57.85 
 
 		 330 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  57.54 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  59.87 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  55.02 
 
 		 319 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  45.08 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  42.03 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  41.2 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  40.51 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  37.69 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  34.46 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  35.69 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.54 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  38.14 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  38.61 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.92 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  31.92 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  38.86 
 
 		 247 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.96 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  41.41 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.54 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  41.91 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  35.08 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  37.05 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.27 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.52 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.96 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.92 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  36.9 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  34.39 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  34.76 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.13 
 
 		 351 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.69 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  38.89 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.55 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  36.73 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  40.47 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.93 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  33.99 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  36.77 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.46 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  34.43 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.84 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  39.44 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  31.31 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.53 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 354 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  32.49 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  29.12 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  29.12 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>