More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1274 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 326 aa  668    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  63.19 
 
 		 326 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  60.68 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  53.08 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  48.78 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  50.69 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  48.62 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  45.57 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  43.16 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  47.12 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  43.62 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  43.69 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  41.74 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  42.15 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  42.68 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.57 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  37.65 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  36.78 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.73 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  34.49 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  35.48 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  34.76 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  34.45 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  36.83 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  37.11 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.64 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.7 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.43 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  35.11 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  38.94 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.97 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  35.92 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  35.92 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.05 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  33.9 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  34.03 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  35.8 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.58 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  34.37 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  38.03 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.93 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  38.01 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.05 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  37.69 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  34.03 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.31 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.01 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  35.62 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  33.99 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.78 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  33.43 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  39.26 
 
 		 313 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  35.42 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  36.76 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  36.76 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  37.99 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  33.9 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.96 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>