279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3942 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
342 aa  680    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  76.06 
 
 
332 aa  504  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  74.62 
 
 
332 aa  461  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  66.57 
 
 
336 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  40.26 
 
 
316 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  37.71 
 
 
325 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  37.71 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  36.86 
 
 
325 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  37.71 
 
 
325 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  36.86 
 
 
325 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 
319 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 
325 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.5 
 
 
324 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  35.17 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  36.44 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.59 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  41.38 
 
 
302 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  38.03 
 
 
326 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.36 
 
 
329 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.63 
 
 
326 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  34.38 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  35.98 
 
 
327 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
331 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 
316 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 
328 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 
331 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 
318 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 
319 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.09 
 
 
323 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 
329 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  31.09 
 
 
323 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.94 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 
326 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.57 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  34.73 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.75 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.27 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  37.17 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  34.96 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 
359 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  39.53 
 
 
327 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  33.89 
 
 
338 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.92 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.05 
 
 
325 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 
328 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 
315 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  36.61 
 
 
330 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.14 
 
 
320 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  36.28 
 
 
330 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  33.61 
 
 
323 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 
319 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.13 
 
 
328 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  39.68 
 
 
334 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  33.61 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.22 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.49 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 
316 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.03 
 
 
305 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 
323 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  29.75 
 
 
322 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  38.86 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.1 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.11 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  36.02 
 
 
313 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 
320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.22 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 
320 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  36.61 
 
 
323 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.81 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.66 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 
333 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  38.55 
 
 
333 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 
313 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  28.92 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.46 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  34.51 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  36.96 
 
 
325 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 
311 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>