285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3634 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 325 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  74.01 
 
 		 310 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  68.9 
 
 		 303 aa  411  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  51.82 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  46.43 
 
 		 320 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.12 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.9 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.67 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  38.67 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  32.04 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  37.45 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.55 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  37.45 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.92 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  34.65 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.35 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.47 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.67 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 314 aa  96.3  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  34.83 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.83 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  36.57 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.18 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  31.12 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  35.6 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.64 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.72 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.34 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.84 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.34 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  34.82 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.87 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.58 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.93 
 
 		 326 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  29.82 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  34.1 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.72 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  34.94 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  36.32 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.5 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.39 
 
 		 330 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 326 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.93 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  35.48 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  36.63 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  32.86 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.03 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  28.13 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.88 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.75 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  34.87 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  35.38 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>