270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3083 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 344 aa  689    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  52.17 
 
 		 335 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.83 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.6 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.75 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.45 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.39 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.09 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  34.52 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.48 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.17 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.46 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.03 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  28.93 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.08 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.98 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.97 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  33.63 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.29 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.37 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.45 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  34.4 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.99 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6348  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.2 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  29.27 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 		 359 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.47 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.38 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.92 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  29.19 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  32.23 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  32.23 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.61 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.13 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.83 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.45 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.69 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  26.1 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.58 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.28 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.29 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  35.68 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>