298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1536 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
333 aa  644    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  69.91 
 
 
328 aa  458  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.43 
 
 
324 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 
325 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  31.04 
 
 
326 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.59 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.9 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.45 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  38.02 
 
 
305 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.66 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.8 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 
327 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.76 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
328 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 
313 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.46 
 
 
323 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.95 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.24 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.11 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  30.45 
 
 
346 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.72 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 
319 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.81 
 
 
328 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 
320 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.29 
 
 
289 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 
326 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 
331 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 
333 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 
323 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
312 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
322 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.66 
 
 
338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 
336 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.74 
 
 
319 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.79 
 
 
318 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.3 
 
 
332 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.6 
 
 
309 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 
320 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 
323 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 
325 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 
325 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 
325 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  31.52 
 
 
329 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 
311 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 
324 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.81 
 
 
298 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.82 
 
 
296 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  30.15 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.31 
 
 
336 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.51 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 
311 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
289 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 
320 aa  95.9  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.12 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.74 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.68 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.7 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  30.58 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  25.77 
 
 
315 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  30.22 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.06 
 
 
310 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31 
 
 
305 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  25.49 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  25.49 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  26.21 
 
 
340 aa  92.8  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  30.97 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>