280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4262 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 335 aa  663    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  52.17 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.74 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 332 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 		 327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  30.32 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  34.78 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.85 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.35 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.25 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.96 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.97 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.68 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.43 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 331 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.83 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.06 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.19 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.1 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  32.32 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  34.14 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.82 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.61 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  24.46 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.19 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.08 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.99 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.47 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.33 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.51 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  35.47 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.84 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  28.1 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.79 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  33.17 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.14 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.34 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  31.35 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  33.17 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>