279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 340 aa  688    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  58.21 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  56.08 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  58.04 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  55.06 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  58.68 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  56.25 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  58.24 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  55.79 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  54.9 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  56.72 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  54.19 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  54.41 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  53.35 
 
 		 365 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  55.59 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  55.89 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  54.3 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  54.27 
 
 		 352 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  53.29 
 
 		 365 aa  345  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  56.27 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  52.07 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  56.57 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  56.57 
 
 		 343 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  52.35 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  52.35 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  51.47 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  53.45 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  50.3 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  49.26 
 
 		 354 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  53.82 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  53.53 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  53.53 
 
 		 359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  52.65 
 
 		 359 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  48.81 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  53.39 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  57.19 
 
 		 350 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  52.35 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  49.28 
 
 		 366 aa  319  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  59.62 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  47.75 
 
 		 339 aa  312  6.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  50.61 
 
 		 362 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.9 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.9 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  45.26 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.3 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.2 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  35.42 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  37.23 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.83 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.6 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.84 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  37.77 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.5 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  33.66 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.92 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  33.65 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  36.07 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.97 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.91 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  36.71 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  34.54 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.19 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  35.55 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  33.59 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  37.16 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  37.38 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  29.23 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  38.53 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>