More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_140 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 319 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  84.01 
 
 		 319 aa  551  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  47.24 
 
 		 331 aa  288  6e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  49.35 
 
 		 320 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  44.79 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  45.31 
 
 		 329 aa  271  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  47.3 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  43.69 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  41.13 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  41.19 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  47.22 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  43.4 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  44.83 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.55 
 
 		 351 aa  249  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  47.7 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  41.41 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  39.73 
 
 		 345 aa  189  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  36.6 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  36.6 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  38.51 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.68 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 325 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 325 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  36.76 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  37.42 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  36 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  35.85 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  36.62 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.06 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  35.85 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.83 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  35.08 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.83 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  37 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.33 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  36.1 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.89 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.21 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.89 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  36.64 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.66 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  39.34 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  39.34 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  36.26 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.74 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 359 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.34 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  31.94 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  35.16 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  31.35 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  33.54 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 358 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  33.7 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.11 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>