296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1146 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 319 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  44.97 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  39.31 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  40.69 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  41.46 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  39.6 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  42.07 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  41.91 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  44.01 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  48.09 
 
 		 312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  39.81 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  42.68 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  40.92 
 
 		 321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  40 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  51.32 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  38.51 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  39.01 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.29 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  38 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.94 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  37.12 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  36.83 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.09 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.96 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.9 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  38.69 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.6 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.2 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  36.9 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.91 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.22 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.05 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  34.73 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 345 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.97 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  35.77 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  37.58 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.79 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  34.39 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.66 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.28 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  34.97 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  35.09 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  36.61 
 
 		 357 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.79 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.98 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  35.89 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  34.98 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  34.26 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.2 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.2 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  34.88 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 348 aa  122  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.71 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  33.91 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  33.91 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.8 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  36.75 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  37.23 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>