253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2310 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 357 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  76.74 
 
 		 348 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  74.41 
 
 		 358 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  73.24 
 
 		 358 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  72.65 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  69.1 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  68.8 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  69.35 
 
 		 350 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  68.91 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  66.76 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  66.86 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  59.23 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  58.68 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  58.21 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  57.19 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  54.63 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  54.33 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  56.25 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  54.97 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  53.78 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  53.78 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  54.57 
 
 		 382 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  57.59 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  54.38 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  58.56 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  54.28 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  54.38 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  54.38 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  57.96 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  58.9 
 
 		 334 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  54.35 
 
 		 349 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  52.96 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  52.48 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  52.68 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  52.41 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  52.1 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  51.8 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  51.2 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  50.9 
 
 		 359 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  50.15 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  50.9 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  55.49 
 
 		 350 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  57.73 
 
 		 328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  40.54 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  40.72 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  40.72 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.6 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  32.81 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32.14 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.57 
 
 		 319 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.24 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 		 320 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.96 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 325 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 321 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  29.14 
 
 		 313 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  31.18 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 323 aa  93.2  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.09 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 		 326 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 321 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.86 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.94 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.69 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.11 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>