288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6207 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 321 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  76.32 
 
 		 321 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  69.16 
 
 		 321 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  69.25 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  67.08 
 
 		 321 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  62.62 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  64.8 
 
 		 320 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  63.24 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  61.59 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  62.62 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  46.93 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  40.37 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.65 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.34 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  35.65 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  35.65 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.08 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  35.6 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  40.45 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.87 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  40.53 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  41.79 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.94 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  34.39 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.05 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.32 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  36.04 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.54 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  32.7 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  33.97 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.99 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.27 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.22 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.03 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  33.77 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  36.03 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.72 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.01 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.74 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  31.14 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  34.39 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.52 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.23 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  36.18 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  35.58 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.61 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.12 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.69 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  29.84 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.09 
 
 		 323 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  35.62 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.99 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  33.91 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.89 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  34.32 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 350 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>