266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2702 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 321 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  85.98 
 
 		 321 aa  558  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  68.01 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  67.39 
 
 		 321 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  69.25 
 
 		 320 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  63.98 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  65.84 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  64.54 
 
 		 345 aa  414  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  66.33 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  67.08 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  48.15 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  42.07 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  34.31 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.48 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  32.85 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.88 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.36 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  34.43 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  35.78 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  35.37 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  33.65 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  38.68 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.97 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  36.63 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  36.58 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  33.08 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  34.65 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.95 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.77 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.79 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.83 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.78 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  33.44 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.56 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.58 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  32.32 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.35 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.37 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.44 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.93 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.11 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  31.33 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  30.23 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  34.26 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.04 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  31.03 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.81 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.88 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  30.77 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.88 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.25 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.98 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  32.55 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  30.64 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  37.16 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.17 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>