286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3303 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 353 aa  707    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  56.51 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  55.62 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  56.98 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  57.35 
 
 		 350 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  58.24 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  53.96 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  53.78 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  54.73 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  54.44 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  54.36 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  55.33 
 
 		 348 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  53.1 
 
 		 366 aa  355  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  52.14 
 
 		 358 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  51.17 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  52.03 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  49.71 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0279  ornithine cyclodeaminase  53.23 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.815207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3030  ornithine cyclodeaminase  54.68 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  50 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  48.7 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2802  ornithine cyclodeaminase  53.94 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2926  ornithine cyclodeaminase  53.67 
 
 		 343 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.438902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  49 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  49.55 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  52.33 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  51.18 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  49.26 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  52.03 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3577  ornithine cyclodeaminase  52.33 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  51.45 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  48.66 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  50.72 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  46.22 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5311  ornithine cyclodeaminase  51.45 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  48.27 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0586  ornithine cyclodeaminase  50.29 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0586  ornithine cyclodeaminase  48.06 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.766094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  46.51 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0592  ornithine cyclodeaminase  53.96 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2671  ornithine cyclodeaminase  48.99 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0613  ornithine cyclodeaminase  54.89 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  44.44 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  42.19 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  42.19 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  37.5 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  38.98 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.7 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.49 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.52 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  35.67 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.14 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  34.84 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.11 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  35.96 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  32.94 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  34.14 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 326 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.36 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  37.89 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  31.31 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 315 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  33.47 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.12 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.23 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.52 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.94 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.17 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>