260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0007 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  99.56 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  55.16 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  53.77 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  52.9 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  38.73 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  37.41 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  37.66 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  36.46 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  37.76 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  39.78 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3802  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 100 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  37.8 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  37.2 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  35.92 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  37.41 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.44 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  34.63 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  36.14 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  35.99 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  35.67 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  36.99 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  38.36 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.87 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  36.64 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  36.3 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  36.3 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  30.69 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.93 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.88 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.83 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.2 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.55 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.66 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.21 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.72 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.39 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.62 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  28.29 
 
 		 353 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.13 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  25.57 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  27.09 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  26.92 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  28.77 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>