289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003670 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 324 aa  668    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  50.94 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  51.72 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  48.29 
 
 		 318 aa  330  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  51.42 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  51.28 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  49.53 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  46.08 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.27 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  38.2 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  35.92 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  41.53 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  39.94 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  37.26 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.7 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  36.56 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  38.17 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  35.99 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.89 
 
 		 348 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 314 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.64 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.78 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.63 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.76 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  37.45 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.29 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.44 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.44 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.86 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  32.6 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.1 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  37.18 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.09 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.83 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.95 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.38 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.27 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.39 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.85 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.64 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  27.96 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.48 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.56 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.96 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 330 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>