277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2150 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  100 
 
 
327 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  70.82 
 
 
333 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  73.25 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  73.01 
 
 
334 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  72.64 
 
 
334 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  72.39 
 
 
334 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  63.94 
 
 
330 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  72.09 
 
 
334 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  72.09 
 
 
334 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  72.39 
 
 
334 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  59.39 
 
 
329 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  59.69 
 
 
325 aa  351  8.999999999999999e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  59.7 
 
 
330 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  59.82 
 
 
330 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  56.67 
 
 
338 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  58.48 
 
 
330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  61.76 
 
 
327 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  52.6 
 
 
319 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  46.45 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  36.81 
 
 
331 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  36.31 
 
 
316 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  35.49 
 
 
329 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  39.26 
 
 
315 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  38.93 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  36.14 
 
 
317 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  36.14 
 
 
317 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  35.42 
 
 
326 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  36.57 
 
 
324 aa  165  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  33.23 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  37.11 
 
 
350 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  36.6 
 
 
346 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.62 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  34.8 
 
 
323 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 
327 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  36.24 
 
 
321 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.59 
 
 
325 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
325 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 
325 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 
333 aa  144  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.59 
 
 
325 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  31.71 
 
 
323 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  39.53 
 
 
342 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 
311 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  36.23 
 
 
247 aa  142  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34.88 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  31.71 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  36.11 
 
 
326 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  35.66 
 
 
321 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  38.8 
 
 
313 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 
319 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  36.31 
 
 
332 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  34.59 
 
 
320 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  34.58 
 
 
330 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  34.31 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
331 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.5 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.21 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  37.8 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 
326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.99 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.46 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.55 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.11 
 
 
321 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 
345 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  33.22 
 
 
337 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  33.11 
 
 
321 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 
338 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 
317 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.18 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 
359 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2564  Ornithine cyclodeaminase  37.65 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0450011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.74 
 
 
329 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 
324 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30.42 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.92 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 
323 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 
345 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>