More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3992 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 323 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  56.73 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  52.24 
 
 		 311 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  52.55 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  53.85 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50.52 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  47.17 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  49.52 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  49.84 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  46.2 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  45.74 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  47.8 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  44.55 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.3 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  40.06 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  43.95 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  37.42 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  37.74 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  41.82 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.94 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  33.86 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.29 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  43.46 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  40.82 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  38.82 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  40.41 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.96 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  38.52 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  36 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  36.39 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.53 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  40.38 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.01 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.31 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.31 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  35.35 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.16 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  36.33 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  31.88 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.67 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.34 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.03 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  37.2 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  36.61 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  33.6 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  36.61 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.47 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  35.34 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.2 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 353 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  36.84 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.46 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  34.32 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  34.41 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  34.14 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.68 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  31.88 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>