272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1976 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 350 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  38.8 
 
 		 315 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  38.8 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  36.83 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  41.03 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  37.86 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  37.86 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  40.28 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  37.97 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  41.37 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  37.54 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.36 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.09 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 		 314 aa  143  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  37.11 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  34.64 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  37.18 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.58 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  40.31 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  36.65 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.94 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.46 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.89 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  38.93 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  37.42 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.99 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  38.36 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  37.34 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.77 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  36.71 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.94 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.13 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.49 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  37.03 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  37.03 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.19 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.91 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 		 325 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  30.85 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.09 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.13 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.23 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.66 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.5 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  37.65 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3799  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.1 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  35.4 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.51 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.08 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>