299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3726 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 318 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  75.8 
 
 		 315 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  70.57 
 
 		 318 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  69.65 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  58.6 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  58.86 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  54.92 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  50.94 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.68 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.01 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  39.24 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  35.95 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  36.68 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 314 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  33.12 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  36.22 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  35.14 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.53 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.59 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.76 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.07 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.5 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.19 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.19 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 302 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.38 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.6 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  35.1 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.06 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.75 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.18 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.12 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.54 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.19 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.57 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  27.39 
 
 		 332 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  27.6 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  30.14 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  24.76 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.4 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.44 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  24.05 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  25.97 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.54 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  28.25 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.19 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.52 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  28.9 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  25.94 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>