297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3226 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 341 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  39.48 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  44.69 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.21 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  40.2 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  38.62 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  35.13 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  38.89 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.58 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  38.14 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  35.99 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  39.61 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.91 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  38.14 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  38.22 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.78 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  36.03 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.14 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  29.49 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  35.26 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.19 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.56 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.93 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.03 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.4 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.07 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  33.2 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.75 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.79 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.83 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  29.84 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.82 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.3 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.29 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  30.58 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.04 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  29.74 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.62 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.35 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.58 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.14 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.67 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 321 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.47 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  29.84 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  29.81 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 357 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.62 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 369 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>