235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3381 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 330 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  85.4 
 
 		 322 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  56.44 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  56.44 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  55.35 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  48.54 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  49.51 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  47.71 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  45.02 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  47.32 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  39.68 
 
 		 466 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.06 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.02 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  39.09 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  40.99 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  37.78 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  38.73 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  38.73 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  38.08 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  38.05 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  38.63 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  38.63 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  37.69 
 
 		 315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  38.01 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.83 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.35 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.69 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.13 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.13 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.39 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.9 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.52 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.19 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.82 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.01 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  32.28 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.23 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.83 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.09 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.17 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.85 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.72 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  27.93 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.38 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.55 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  25.62 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  26.88 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.49 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  25.15 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.73 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  31.76 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  26.72 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.34 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  23.84 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>