208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1765 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  100 
 
 		 466 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  88.75 
 
 		 311 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  68.83 
 
 		 305 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  59.12 
 
 		 323 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  60.58 
 
 		 370 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  60.58 
 
 		 317 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  60.58 
 
 		 317 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  59.87 
 
 		 310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  58.92 
 
 		 315 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  58.92 
 
 		 315 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  58.92 
 
 		 315 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  58.92 
 
 		 315 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  60.93 
 
 		 325 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  60.93 
 
 		 325 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  60.6 
 
 		 325 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  60.33 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  60 
 
 		 311 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  59.52 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  53.99 
 
 		 312 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.08 
 
 		 296 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.47 
 
 		 298 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  38.2 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  40 
 
 		 305 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  39.68 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  41.33 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  37.08 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  36.62 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  36.47 
 
 		 334 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  38.61 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  34.11 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 316 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 		 320 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.8 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.41 
 
 		 325 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.41 
 
 		 325 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.7 
 
 		 325 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.29 
 
 		 310 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.8 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 325 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 325 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 325 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 327 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 323 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.34 
 
 		 296 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.62 
 
 		 323 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.47 
 
 		 323 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.97 
 
 		 324 aa  94  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  36.63 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 332 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 308 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 333 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 		 306 aa  87.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.12 
 
 		 328 aa  86.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  32.42 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.92 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.38 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  31.92 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  30.24 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.57 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  27.96 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.08 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.94 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  24.59 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.41 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  37.08 
 
 		 315 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.97 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.71 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.94 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.64 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.28 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 303 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.36 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.96 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.65 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  25.63 
 
 		 314 aa  67  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  26.72 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.2 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>