211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4907 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 311 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  88.75 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  70.13 
 
 		 305 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  58.57 
 
 		 323 aa  341  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  60.26 
 
 		 370 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 317 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  60.26 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  61.18 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  60.33 
 
 		 311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  60 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  59.8 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  59.8 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  59.73 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  59.47 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  53.33 
 
 		 312 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.64 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.94 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  43.8 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  38.06 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  37.21 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  38.46 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  38.15 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  38.3 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  34.91 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  37.25 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 341 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.48 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.9 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.75 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.64 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.47 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.62 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.53 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  27.96 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.1 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  32.49 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.08 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  32.32 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  27.96 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.22 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.61 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  29.61 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.94 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.69 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.72 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.34 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.56 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.44 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.69 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.07 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.63 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  30.7 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.12 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  25.63 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  27.05 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  28.85 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44059  predicted protein  24.46 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273474  normal  0.171571 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>