More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2670 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  58.17 
 
 		 303 aa  341  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  57.84 
 
 		 303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  58.09 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.33 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.51 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.41 
 
 		 313 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  37.74 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.49 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  43.7 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  36.21 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  39.16 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.34 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  38.35 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  36.76 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  35.1 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  36.82 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  32.88 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  37.55 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  36.86 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 		 316 aa  128  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.37 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.86 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.86 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.59 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  33.71 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  36.05 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 341 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 327 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.41 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.63 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.21 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.46 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.05 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  25.87 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.91 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.24 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.11 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  30.97 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.98 
 
 		 346 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.88 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  32.43 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  31.7 
 
 		 338 aa  89  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.81 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  32.14 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.02 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.08 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  30.97 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  30.73 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.88 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  25.53 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.2 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  36.79 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>