285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2610 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 317 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  58.86 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  59.55 
 
 		 315 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  56.96 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  58.33 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  54.14 
 
 		 314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  48.28 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  49.53 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.49 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.42 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  37.38 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  38.66 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  36.18 
 
 		 323 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  39.3 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  35.42 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  37.14 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  37.97 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  37.42 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  38.8 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.37 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.44 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  35.62 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.61 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  35.35 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.57 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  36.47 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.41 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.38 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  34.12 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.67 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.62 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  33.86 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.56 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  34.25 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  30.51 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.2 
 
 		 340 aa  122  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.43 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  30.18 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.7 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.14 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.63 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.63 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  29.14 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.5 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.46 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.07 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  31.73 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  28.84 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.65 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.31 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.8 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  28.14 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.73 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  28.08 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.09 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.63 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  28.02 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 314 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>