291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5460 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  42.58 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.56 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.67 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.07 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.04 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  36.48 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  43.46 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  38.76 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  38.41 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  38.82 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  39.81 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  37.67 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  37.26 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  37.67 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  39.85 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  37.79 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  34.97 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  38.51 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  39.49 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  39.37 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  34.97 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  35.44 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  36.04 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  39.44 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  34.32 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  35.49 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  33.76 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  29.25 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  35.38 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  36.21 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.66 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.18 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.95 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.55 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  33.56 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.92 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  29.48 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.69 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  34.94 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.95 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  35.14 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.92 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.55 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 350 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 342 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.14 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.8 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  35.21 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  30.71 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.26 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.49 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.53 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.91 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.16 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.17 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  31.53 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.68 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.05 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  28.64 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  33.48 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  32.79 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  29.82 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.33 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>