More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7814 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 348 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  53.8 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  50.53 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  46.39 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  51.3 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  49.84 
 
 		 318 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  46.64 
 
 		 316 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  48.16 
 
 		 314 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  44.97 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  46.67 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.3 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  51.82 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  49.2 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  48.77 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  38.39 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  47.99 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.45 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  34.82 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  36.42 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.86 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  40.47 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  42.52 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  39.74 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  38.31 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  37.97 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  34.09 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  37.18 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  40.19 
 
 		 328 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  43.96 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  38.03 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  38.34 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.91 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  34.18 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.03 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.42 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  33.82 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.18 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.66 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  34.03 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.21 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.91 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  34.02 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.24 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.25 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  36.16 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.22 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.65 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.01 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  37.05 
 
 		 329 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.3 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.83 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  36.54 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  36.59 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.89 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  32.44 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  35.27 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.31 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.21 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  34.3 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.42 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.3 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.42 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.59 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  35.81 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  34.34 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  32.61 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.36 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  32.21 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  36.93 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  37.9 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>