More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1163 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
318 aa  637    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  43.4 
 
 
317 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  38.8 
 
 
316 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  36.48 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  36.71 
 
 
318 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  40.25 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  39.88 
 
 
312 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  36.45 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.64 
 
 
318 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  32.62 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 
328 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.56 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.28 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  38.17 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
325 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  37.7 
 
 
325 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
325 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
325 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 
325 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  38.11 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  37.3 
 
 
325 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.1 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  36.1 
 
 
325 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.12 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 
320 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.17 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  27.84 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.38 
 
 
323 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.9 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.76 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.87 
 
 
303 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  29.54 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 
326 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.54 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  32.35 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.1 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.1 
 
 
304 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.96 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  29.18 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 
335 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  27 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.37 
 
 
310 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.81 
 
 
348 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.96 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.41 
 
 
331 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 
323 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.82 
 
 
306 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.16 
 
 
325 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.11 
 
 
296 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 
330 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 
314 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 
305 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.79 
 
 
340 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.3 
 
 
316 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 
338 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 
338 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 
317 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  25.9 
 
 
320 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.47 
 
 
312 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.96 
 
 
298 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 
329 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.81 
 
 
323 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  27.65 
 
 
319 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30 
 
 
328 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  27.5 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  27.15 
 
 
315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 
329 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  26.11 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  30.36 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.04 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  31.47 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  25.26 
 
 
323 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  26.52 
 
 
338 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>