More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2200 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 313 aa  597  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  75.65 
 
 		 315 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  51.45 
 
 		 315 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.3 
 
 		 348 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  50.64 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  45.64 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  48.87 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.6 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  46.1 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  39.94 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  41.96 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  40.19 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  48.41 
 
 		 315 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  36.01 
 
 		 318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  41.48 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  36.16 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  49.18 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  43.51 
 
 		 314 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  41.27 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  47.85 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  40.71 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  39.42 
 
 		 317 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.04 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  45.15 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  44.78 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  44.19 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.46 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  42.8 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  34.17 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.66 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  40.84 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  38.87 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  34.5 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.33 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.19 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  35.31 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  42.61 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.93 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  35 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  34.69 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  37.93 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.48 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  39 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.48 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  34.06 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  35.83 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  36.99 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  36.17 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  34.5 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.43 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  40.79 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.84 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.76 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  35.37 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  37.36 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.14 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  32.94 
 
 		 330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  34.6 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  36.9 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  39.62 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  36.1 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  35.86 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.04 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.2 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  32.62 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  35.93 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.1 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 350 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  32.9 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  39.53 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  29.34 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.86 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>