271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0054 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  65.31 
 
 
303 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  64.97 
 
 
303 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  64.63 
 
 
303 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  56.21 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  45.61 
 
 
316 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.06 
 
 
348 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  36.8 
 
 
315 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.49 
 
 
312 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  34.4 
 
 
314 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.08 
 
 
313 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  37.85 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  36.57 
 
 
318 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.84 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  38.13 
 
 
315 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 
332 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  37.36 
 
 
315 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  36.21 
 
 
323 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 
319 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  32.82 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  34.9 
 
 
324 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  32.8 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.5 
 
 
325 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 
325 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
325 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 
325 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
325 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 
325 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
328 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 
314 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 
325 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  34.25 
 
 
317 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.17 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  35.52 
 
 
315 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.25 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  35.06 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  35.05 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  30.33 
 
 
323 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  30.33 
 
 
323 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 
324 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 
341 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 
314 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  29.88 
 
 
319 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  31.3 
 
 
326 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 
326 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 
313 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
316 aa  99  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.22 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.17 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.56 
 
 
340 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.37 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.27 
 
 
327 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.69 
 
 
319 aa  92.4  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 
326 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.3 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.8 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.4 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.74 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  28.57 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  27.91 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  29.2 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  27.84 
 
 
330 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.86 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.38 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  30.27 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  27.41 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.57 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  27.87 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  28.02 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  27.72 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  24.82 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.63 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  26.86 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  30.57 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.53 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>