More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2024 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 332 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.27 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.08 
 
 		 348 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  50.64 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  51.13 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  45.14 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  46.37 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  43.67 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  49.63 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  45.19 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  45.86 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50.9 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  44.41 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  48.52 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  37.78 
 
 		 314 aa  212  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  41.97 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  43.14 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  37.34 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  36.68 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  38.1 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  34.38 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.79 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  41.92 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  38.68 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  37.78 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  38.2 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.59 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  38.54 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  38.35 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  40.82 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  36.92 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  36.54 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  35.77 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  37.45 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.45 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.46 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.35 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.35 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  34.54 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.87 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  34.57 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  36.22 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.62 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.85 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.86 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.84 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  35.43 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  39.3 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  37.29 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  36.65 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.06 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.47 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.4 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.55 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.24 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  32.37 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  25.3 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  32.45 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  33.2 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.29 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  32.92 
 
 		 466 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  31.52 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.31 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  31.72 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  32.56 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.63 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.44 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.5 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  28.11 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.49 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>