269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0429 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.2 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  53.22 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  50.32 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  49.85 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  49.54 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  49.51 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  48.79 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  47.18 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.94 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  39.47 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  47.85 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.83 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  39.17 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  40.78 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  40.45 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  40.13 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  40.45 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  40.13 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  40.13 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  40.13 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  38.64 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  39.78 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  38.69 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  38.03 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  36.93 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  36.93 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  36.6 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.63 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  37.11 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.28 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.93 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  37.68 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.62 
 
 		 346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.35 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  35.99 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  33.67 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.26 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.97 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  36.98 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.67 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.5 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.28 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  34.96 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  30.5 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.96 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  32.81 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.31 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.09 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.98 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.43 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  35.39 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.23 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.33 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.91 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.09 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 328 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.74 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  32.69 
 
 		 314 aa  89  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.02 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.48 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.87 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.85 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.62 
 
 		 348 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  30.17 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  32.78 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.67 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>