255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0244 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 
304 aa  620  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.83 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.45 
 
 
302 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.18 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 
325 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.53 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 
305 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.53 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 
298 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.66 
 
 
325 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.34 
 
 
319 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 
288 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 
341 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 
319 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 
325 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 
325 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 
325 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 
325 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.76 
 
 
310 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 
325 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
325 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.64 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1192  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.87 
 
 
289 aa  99  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 
324 aa  99  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 
326 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  26.37 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  27.67 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  25.65 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 
326 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.74 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  29.07 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 
317 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.52 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  28.89 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.19 
 
 
305 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.01 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.87 
 
 
298 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.9 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.61 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  26.82 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  25.86 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.57 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  29.41 
 
 
466 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  28.06 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.66 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  25.56 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  25.61 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
329 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 
323 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.58 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.59 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  25.11 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  28.8 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  30.8 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25.41 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  30.05 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  27.19 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.02 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.07 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  24.83 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  23.47 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  24.3 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  24.29 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  24.46 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.4 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.45 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.95 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>