209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1457 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
323 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  87 
 
 
370 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  86.69 
 
 
317 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  87 
 
 
317 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  86.38 
 
 
315 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  86.38 
 
 
315 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  86.38 
 
 
315 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  86.38 
 
 
315 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  59.49 
 
 
305 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  59.12 
 
 
466 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  58.81 
 
 
311 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  58.97 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 
325 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 
325 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  59.94 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  61.31 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  59.37 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  59.87 
 
 
311 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  52.29 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  46.81 
 
 
313 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  40.06 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.14 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.17 
 
 
298 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  38.9 
 
 
333 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  38.64 
 
 
305 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  40.6 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  37.04 
 
 
322 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  38.32 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  37.11 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  38.17 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 
341 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 
325 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 
325 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.05 
 
 
325 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  26.01 
 
 
316 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 
325 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 
320 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.93 
 
 
346 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 
325 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 
325 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 
325 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 
325 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  34.16 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.48 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.11 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 
302 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.2 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.17 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  34.67 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  28.19 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.56 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 
332 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.88 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.96 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.94 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  32.11 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  25.4 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  31.13 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.53 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.56 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.56 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.62 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.68 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  27.97 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.38 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  29.51 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.7 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  34.56 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.95 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  27.59 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.2 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  30.18 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  28.35 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  34.17 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.43 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.91 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.94 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.91 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.7 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  35.29 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  29.7 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.53 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>