271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1509 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 313 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  44.04 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  46.6 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  46.52 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  48.23 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  48.21 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  48.53 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  46.51 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  43.97 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  42.05 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  41.64 
 
 		 466 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3352  ornithine cyclodeaminase  44.04 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.568086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3222  ornithine cyclodeaminase  41.28 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  45.7 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  45.36 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  45.36 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  45.36 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  45.36 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  41.46 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  45.42 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  45.33 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3546  ornithine cyclodeaminase  40.67 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  39.69 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.61 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2152  ornithine cyclodeaminase  37.75 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1338  ornithine cyclodeaminase  41.25 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175069  decreased coverage  0.000124855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.39 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  33.78 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.77 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.65 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.95 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.28 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  34.94 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  36.88 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.98 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.87 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.9 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.29 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  34.2 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 323 aa  89  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.93 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  34.75 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.35 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.74 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  27.81 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.86 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.82 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.95 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  35.23 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.1 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.48 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  26.25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  31.9 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.29 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.63 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  24.09 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  30.25 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  35.4 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  28.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.97 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00454  proline utilization protein PrnX-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04440)  28.76 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.212442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  22.7 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.2 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.35 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>